關於此次2019-nCoV(武漢肺炎)整理的一些筆記分享如下，我會不定時更新內容。
最後更新：10 Feb, 2020
時間軸
簡單將確診病例依時間製圖如下
台灣目前確診病例整理至2/10
參考目前發布的指引及醫學文獻整理的筆記如下
已知有六種會感染人類的冠狀病毒，2019-nCoV跟SARS同屬beta CoV，至少有大於七成的相似性(NEJM的文章提到跟bat SARS-like CoV有85%相似)。
右半部圖片參考自Nature review microbiology 2018年的回顧文章，此處intermediate host和在討論寄生蟲時的中間宿主概念並不完全相同，病毒也可以直接由natural host感染人類，不一定需要透過intermediate host。目前2019-nCoV的動物來源並無確定的科學證據，蝙蝠仍為最可疑的來源，但最終結果仍續進一步科學研究證實。
上表參考自1/23中國官方公布的文件(連結如下)，其中描述了17名死亡案例的臨床資訊，我簡單整理如上表，男性居多(76.5%)，平均年紀偏大(73)，且多有潛在疾病。另外大概可看出從進展為呼吸衰竭需插管到死亡疾病惡化進程快速。
http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqtb/202001/5d19a4f6d3154b9fae328918ed2e3c8a.shtml
上表主要參考疾管署的指引以及 JAMA於1/23的短文，關於2019-nCoV的病生理及傳播特性，目前根據過去SARS及MERS的經驗，專家們已有初步假設，但仍待進一步的研究以證實目前科學上的假說。
隨著疾病的演進，上表中的內容也隨時可能更改。例如疫情初期雖尚無人傳人證據，但隨著在15名醫護人員感染的情形被證實後，人傳人的假說等於間接被證實，也改寫了我們對於疾病傳播方式的認知。未來針對傳播途徑，社區及醫療場所傳播模式，以及是否存在super spreader，都是必須持續關注研究的議題。
Lancet火速在1/24刊出兩篇文章，其中一篇題目為Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China，整理了最初41名個案的臨床表現包含症狀學、影像學、以及臨床檢驗數據。
這41名病患的平均年齡為49歲，男性為多(73%)，20%有糖尿病，15％有高血壓，15％有心血管疾病。
症狀方面按照發生比例依序為：發燒(98%)，咳嗽(76%)，喘(55%，平均出現於發病後八天)，肌肉痠痛或肢體無力(44%)，痰(28%)，頭痛(8%)，咳血(5%)，腹瀉(3%)。
影像上所有的病患皆有異常胸腔電腦斷層發現，高達98％的病患雙側肺部皆受影響。
在這41名病患中，32％的病患須接受加護病房照護，15%的病患不幸死亡。這個小樣本數得出的統計資料，並無法完全代表實際病原致病能力跟臨床嚴重程度，解讀資料時應謹慎並避免過度渲染。
另一座山頭NEJM 1/24也發表了一篇標題為A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019的文章，內容主要是針對最初三名個案呼吸道檢體的病毒學分析。
Lancet於1/29再發表一篇個案數增加到99名的描述性研究。
這99名病患的平均年齡為55.5歲，男性為多(68%)，12%有糖尿病，40％有心血管或腦血管疾病。49%的病患有華南海鮮市場暴露史。
症狀方面按照發生比例依序為：發燒(83%)，咳嗽(82%)，喘(31%)，肌肉痠痛(11%)。
17%的病人併發急性呼吸窘迫症候群(ARDS)，4%的病患需要侵入性呼吸器，3％的病患使用葉克膜輔助治療。死亡率為11％。
解讀資料時仍需注意這些病患皆為住院病患，統計結果不能直接擴大解釋套用所有病患群體。此外這篇文章的資料整理相對來說比較粗糙，也沒有提供重症與輕症患者的比較
NEJM於1/29同日也發表了一篇文章，內容是描述2019-nCoV初期傳播的流病特性。
此文一出廣受各方抨擊，評論認為根據數據中國早已掌握病毒具人傳人的特性。
這篇文章比較了三段時期，可以看出早期武漢華南市場的暴露比例較高，而接近中後期醫護人員感染的比例升高。
本文統計出平均潛伏期為5.2日，平均serial interval(傳給下一個個案所需時間)為7.5日，而估計的R0值(一個感染個案可以傳染給幾個人)則為2.2。
NEJM 1/31日刊出這篇個案報告，描述了美國境內第一例確診個案的診治過程。
該個案自武漢返美後隔日出現症狀，在發病後第四天至急診，隔日收治住院，住院第五天(發病後九天)進展至肺炎。在住院第七天使用remdesivir，隔日退燒且脫離氧氣治療。
此例報導後，各方對於remdesivir產生高度期待。但此例僅為單一個案，且病毒感染後改善可能只是自體免疫系統對抗病毒的結果，不宜過度詮釋。目前中國已開始進行隨機分配臨床試驗，該藥是否對2019-nCoV具有療效，仍待研究證實。
JAMA 在2/07刊出一篇截至目前病人數最多(138)的回朔性文章，除了描述臨床特性外，也針對入加護病房和一般病房的病人特性以及死亡與存活個案做了統計分析。
138位病人的平均年齡是56歲，男性佔54%，糖尿病佔10％，心血管疾病佔15％。
本篇研究提到，高達41%的案例與院內感染有關，其中29％為醫護人員，12％為住院病人。
症狀依發生比例依序為發燒(99%)、疲倦(70%)、乾咳(59%)、食慾不振(40%)、肌肉痠痛(35%)、喘(31%平均發生時間為五天後)。
入加護病房的個案年紀較大，有較多共病，在各項檢驗數據異常也有明顯統計上顯著差異(見上圖)。
33位有完整檢驗數據的病患中，比較存活(28)與死亡(5)案例，可見多項數據達到統計上顯著差異(如上圖)。
截至目前為止三篇描述性的研究文獻簡單列表比較如上。
修蛋幾雷，我們剛剛是被NEJM獨立了嗎？
參考資料：
疾管署
https://www.cdc.gov.tw/Category/List/AuFztf_j5e4MaYz-sjteNQ
丁香園: 疫情地圖/實時播報
https://3g.dxy.cn/newh5/view/pneumonia
中國國家衛生健康委員會
http://www.nhc.gov.cn/xcs/yqfkdt/gzbd_index.shtml
WHO
https://www.who.int/emergencies/diseases/novel-coronavirus-2019
CDC
https://www.cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/index.html
ProMed
端傳媒
https://theinitium.com/article/20200106-mainland-wuhan-pneumonia/
Devex
https://www.devex.com/news/2019-ncov-outbreak-a-timeline-96396
Wikipedia
https://en.wikipedia.org/wiki/Timeline_of_the_2019%E2%80%9320_Wuhan_coronavirus_outbreak
胸腔科 蘇一峰 醫師
http://tvgh-suvy.blogspot.com/
https://www.facebook.com/bsbipoke
NEJS
https://www.facebook.com/nejsblog
醫學文獻
NEJM published online on Jan 24, 2020
A Novel Coronavirus from Patients with Pneumonia in China, 2019
https://www.nejm.org/doi/full/10.1056/NEJMoa2001017
Lancet published online on Jan 24, 2020
A familial cluster of pneumonia associated with the 2019 novel coronavirus indicating person-to-person transmission: a study of a family cluster
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30154-9/fulltext
Lancet published online on Jan 24, 2020
Clinical features of patients infected with 2019 novel coronavirus in Wuhan, China
https://www.thelancet.com/journals/lancet/article/PIIS0140-6736(20)30183-5/fulltext
medRxiv published online on Jan 24, 2020
Novel coronavirus 2019-nCoV: early estimation of epidemiological parameters and epidemic predictions
https://www.medrxiv.org/content/10.1101/2020.01.23.20018549v1
viruses published online on Jan 24, 2020
Return of the Coronavirus: 2019-nCoV
https://www.mdpi.com/1999-4915/12/2/135
JAMA published online on Jan 23, 2020
Coronavirus Infections—More Than Just the Common Cold
https://jamanetwork.com/journals/jama/fullarticle/2759815
Nature reviews microbiology published on Dec 10, 2018
Origin and evolution of pathogenic coronaviruses
https://www.nature.com/articles/s41579-018-0118-9
封面圖截自WHO網頁